在使用偏光顯微鏡前需要做好下面這三個檢查工作：

1)確定起偏振鏡或檢偏振鏡振動方向：將檢偏振鏡自鏡中推出、只留一個起偏振鏡觀察工作臺上黑云母切片、轉動工作臺，當黑云母解理與起偏振鏡的振動方向平行時對黑云母吸收性Z強，此時呈現深棕色，當解理與起偏振鏡的振動方向垂直時，黑云母吸收性微弱，此時晶體呈現淡黃色，據此就能確定起偏振鏡的振動方向。

另一個方法是將起偏振鏡自偏光顯微鏡上取下，通過起偏振鏡以較大傾斜角觀察任一光亮的反射表面，轉動起偏振鏡至一暗位置，即可確定起偏振鏡振動方向與水平方向(左右不限)垂直、因光亮表面反射來的部分偏振光振動方向始終是觀察者的左右方向。本儀器上的起偏振鏡振動方向為觀察者的左右方向。

2)起偏振鏡與檢偏振鏡正交：將檢偏振鏡推入(為觀察清楚，應取下目鏡、物鏡及撥開聚光鏡前片)，轉動起偏振鏡，觀察到Z暗位置，即系正交位置，此時起偏振鏡刻線應對準00(1800)。

3)目鏡分劃板十字線與起偏振鏡、檢偏振鏡振動方向平行，檢查方法同(1.1)在單偏光下觀察黑云母切片，當黑云母解理與起偏抵鏡的振動方向平行時，顏色Z深，呈深棕色，此目鏡分劃板十字線之一應與黑云母解理方向平行。