熒光顯微鏡的調整主要在于光源的調整，目前熒光顯微鏡光源主要分為汞燈光源和LED燈光源。

一般LED光源出廠時都會校正好，而且led光源使用壽命長，幾乎無需再更換，人工維護成本低。

而汞燈使用壽命大概在100-200小時，使用過程中會遇到更換燈泡的問題，燈泡更換完成后需要調整中心位置，那如何調整呢？由于激發濾光片、雙色束分離器和阻斷濾光片，出廠時已按其用途和本身的光學特性進行了嚴格的組合匹配，在觀察和攝影時，只需選擇濾光片組即可。那么怎么可以保證光源在光路的中間位置呢？

熒光顯微鏡怎么調熒光，調整方法如下：

1. 請準備一張白紙（約40mmX50mm），將白紙置于載物臺上。

2. 取出其中一個物鏡，將轉換器無物鏡的安裝孔位轉入光路中。此時可以在白紙上呈現一個明亮的光斑，內部有呈蝴蝶結狀的燈絲像。

3. 如果燈絲像不清晰，可以調節落射器集光鏡，使燈絲像清晰。

4. 如果蝴蝶結狀的燈絲像偏離明亮光斑的中心或傾斜，則需要調節汞燈的中心。

5. 重新安裝物鏡并轉動轉換器，將物鏡轉入光路中,就可以利用本儀器進行熒光顯微觀察。