顯微鏡的價格因型號、品質、功能等因素而異，一般的價格范圍在幾百元到幾十萬元之間。其中，學生用顯微鏡的價格一般在幾百元到幾千元之間，專業級的顯微鏡價格則較高，一般在幾萬元以上。

除了光學顯微鏡和電子顯微鏡外，還有一些其他類型的顯微鏡可供選擇。例如，熒光顯微鏡適用于觀察熒光性物質；倒置顯微鏡常用于細胞培養和生物醫學研究；相差顯微鏡可以觀察透明的無色物質等等。而這些特殊類型的顯微鏡的價格也會因其特殊的用途和功能而有所不同。