生物顯微鏡鏡架、鏡臀傾斜時固定不住的問題：

這是鏡架和底座的連接螺絲松動所致。可用專用的雙頭板手或用尖嘴鉗卡住雙眼螺母的兩個孔眼用力旋緊即可。如旋緊后不解決問題，則需在螺母里加墊適當的墊片來解決。

若是目鏡、物鏡鏡頭內部的鏡片被污染或霉變，就必須拆開清洗。目鏡可直接擰開拆下后進行清洗。但物鏡的結構較復雜，鏡片的疊放，各鏡片間的距離都有非常嚴格的要求，精度也很高。生產廠家在裝配時是經過精確校正而定位的。所以拆開清洗干凈后，必須嚴格按原樣裝配好。

生物顯微鏡的鏡片都是用精密加工過的光學玻璃片制成的，為了增加透光率，都需在光學玻璃片的兩面涂上一層很薄的透光膜。這樣透光率就可以達到97％~98％。這一層透光膜表面很平整光滑，且很薄，一旦透光膜表面被擦傷留有痕跡，它的透光率就會受到很大影響，觀察時會變得模糊不清。所以在擦拭要特別小心。